DDR1

DDR1
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволDDR1 ; CAK; CD167; DDR; EDDR1; HGK2; MCK10; NEP; NTRK4; PTK3; PTK3A; RTK6; TRKE
Внешние IDOMIM: 600408 MGI99216 HomoloGene68212 ChEMBL: 5319 GeneCards: DDR1 Gene
номер EC2.7.10.1
Профиль экспрессии РНК
PBB GE DDR1 1007 s at tn.png
PBB GE DDR1 207169 x at tn.png
PBB GE DDR1 208779 x at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez78012305
EnsemblENSG00000137332ENSMUSG00000003534
UniProtQ08345Q03146
RefSeq (мРНК)NM_001202521NM_001198831
RefSeq (белок)NP_001189450NP_001185760
Локус (UCSC)Chr 6:
30.84 – 30.87 Mb
Chr 17:
35.68 – 35.7 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

DDR1 (англ. discoidin domain receptor tyrosine kinase 1; CD167a , КФ 2.7.10.1) — мембранный белок, фермент из надсемейства рецепторных тирозинкиназ, продукт гена DDR1.

DDR1 входит в группу рецепторов, которые содержат домен, гомологичный белку дискоидин 1 из Dictyostelium discoideum.


Функции

Рецептор DDR1 играет роль в межклеточных взаимодействиях и распознавании.[1] Взаимодействие между лейкоцитарным DDR1 и коллагеном облегчает адгезию, миграцию, дифференцировку/созревание лейкоцитов и продукцию ими цитокинов и хемокинов. [2]

Структура

DDR1 — крупный белок, состоит из 895 аминокислот, молекулярная масса белковой части — 101,1 кДа. N-концевой участок (398 аминокислот) является внеклеточным, далее расположен единственный трансмембранный фрагмент и внутриклеточный фрагмент (470 аминокислот). Внеклеточный фрагмент включает 4 участка N-гликозилирования. Цитозольный участок включает протеинкиназный домен, участок связывания с АТФ, 4 аутофосфорилируемых тирозинов и PPxY-мотив.

Рецептор взаимодействует с WWC1 (посредством WW доменов), входит в тримолекулярный комплекс с белками WWC1 и PRKCZ (как правило в несвязанном с коллагеном состоянии).

В результате альтернативного сплайсинга образуются 5 изоформ белка.

Каталитическая активность

Внутриклеточный протеинкиназный домен фосфорилирует собственные остатки тирозина, перенося фосфатную группу с АТФ на гидроксильную группу аминокислоты. Аутофосфорилирование происходит при взаимодействии DDR1 с коллагенами типов I—VI.

Тканевая специфичность

Белок в небольшой степени экспрессирован на эпителиальных клетках большинства тканей, максимальная экспрессия наблюдается в мозге, лёгких, плаценте и почках. Высокая степень экспрессии найдена во многих линиях клеток карциномы, особенно в клетках рака молочной железы. Отсутствует в соединительной ткани, на эндотелиальных клетках, в жировой и мышечной тканях и на гематопоэтических клетах.

См.также

Примечания

  1. Uniprot database entry for CD11a (accession number Q08345)
  2. Yoshimura T, Matsuyama W, Kamohara H (2005). “Discoidin domain receptor 1: a new class of receptor regulating leukocyte-collagen interaction”. Immunol. Res. 31 (3): 219—30. DOI:10.1385/IR:31:3:219. PMID 15888913.

Библиография

  • Yoshimura T, Matsuyama W, Kamohara H (2005). “Discoidin domain receptor 1: a new class of receptor regulating leukocyte-collagen interaction”. Immunol. Res. 31 (3): 219—30. DOI:10.1385/IR:31:3:219. PMID 15888913.
  • Edelhoff S, Sweetser DA, Disteche CM (1995). “Mapping of the NEP receptor tyrosine kinase gene to human chromosome 6p21.3 and mouse chromosome 17C”. Genomics. 25 (1): 309—11. DOI:10.1016/0888-7543(95)80144-B. PMID 7774938.
  • Shelling AN; Butler R; Jones T; et al. (1995). “Localization of an epithelial-specific receptor kinase (EDDR1) to chromosome 6q16”. Genomics. 25 (2): 584—7. DOI:10.1016/0888-7543(95)80065-T. PMID 7789998. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Weiner TM, Liu ET, Craven RJ, Cance WG (1995). “Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors”. Ann. Surg. Oncol. 1 (1): 18—27. DOI:10.1007/BF02303537. PMID 7834423.
  • Laval S; Butler R; Shelling AN; et al. (1995). “Isolation and characterization of an epithelial-specific receptor tyrosine kinase from an ovarian cancer cell line”. Cell Growth Differ. 5 (11): 1173—83. PMID 7848919. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Kato JY, Matsuoka M, Strom DK, Sherr CJ (1994). “Regulation of cyclin D-dependent kinase 4 (cdk4) by cdk4-activating kinase”. Mol. Cell. Biol. 14 (4): 2713—21. PMC 358637. PMID 8139570.
  • Di Marco E; Cutuli N; Guerra L; et al. (1993). “Molecular cloning of trkE, a novel trk-related putative tyrosine kinase receptor isolated from normal human keratinocytes and widely expressed by normal human tissues”. J. Biol. Chem. 268 (32): 24290—5. PMID 8226977. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Perez JL; Shen X; Finkernagel S; et al. (1994). “Identification and chromosomal mapping of a receptor tyrosine kinase with a putative phospholipid binding sequence in its ectodomain”. Oncogene. 9 (1): 211—9. PMID 8302582. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Johnson JD, Edman JC, Rutter WJ (1993). “A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90 (12): 5677—81. DOI:10.1073/pnas.90.12.5677. PMC 46784. PMID 8390675.
  • Perez JL, Jing SQ, Wong TW (1996). “Identification of two isoforms of the Cak receptor kinase that are coexpressed in breast tumor cell lines”. Oncogene. 12 (7): 1469—77. PMID 8622863.
  • Valent A; Meddeb M; Danglot G; et al. (1996). “Assignment of the NTRK4 (trkE) gene to chromosome 6p21”. Hum. Genet. 98 (1): 12—5. DOI:10.1007/s004390050152. PMID 8682498. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Playford MP; Butler RJ; Wang XC; et al. (1996). “The genomic structure of discoidin receptor tyrosine kinase”. Genome Res. 6 (7): 620—7. DOI:10.1101/gr.6.7.620. PMID 8796349. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Sakuma S; Saya H; Tada M; et al. (1997). “Receptor protein tyrosine kinase DDR is up-regulated by p53 protein”. FEBS Lett. 398 (2—3): 165—9. DOI:10.1016/S0014-5793(96)01234-3. PMID 8977099. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Nemoto T; Ohashi K; Akashi T; et al. (1998). “Overexpression of protein tyrosine kinases in human esophageal cancer”. Pathobiology. 65 (4): 195—203. DOI:10.1159/000164123. PMID 9396043. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Tanaka K; Nagayama Y; Nakano T; et al. (1998). “Expression profile of receptor-type protein tyrosine kinase genes in the human thyroid”. Endocrinology. 139 (3): 852—8. DOI:10.1210/en.139.3.852. PMID 9492013. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Vogel W, Gish GD, Alves F, Pawson T (1998). “The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen”. Mol. Cell. 1 (1): 13—23. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9. PMID 9659899.
  • Shrivastava A; Radziejewski C; Campbell E; et al. (1998). “An orphan receptor tyrosine kinase family whose members serve as nonintegrin collagen receptors”. Mol. Cell. 1 (1): 25—34. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80004-0. PMID 9659900. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Vogel W; Brakebusch C; Fässler R; et al. (2000). “Discoidin domain receptor 1 is activated independently of beta(1) integrin”. J. Biol. Chem. 275 (8): 5779—84. DOI:10.1074/jbc.275.8.5779. PMID 10681566. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Foehr ED; Tatavos A; Tanabe E; et al. (2000). “Discoidin domain receptor 1 (DDR1) signaling in PC12 cells: activation of juxtamembrane domains in PDGFR/DDR/TrkA chimeric receptors”. FASEB J. 14 (7): 973—81. PMID 10783152. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Weiner HL; Huang H; Zagzag D; et al. (2001). “Consistent and selective expression of the discoidin domain receptor-1 tyrosine kinase in human brain tumors”. Neurosurgery. 47 (6): 1400—9. DOI:10.1097/00006123-200012000-00028. PMID 11126911. Неизвестный параметр |author-separator= (справка)
  • Mohan RR, Mohan RR, Wilson SE (2001). “Discoidin domain receptor (DDR) 1 and 2: collagen-activated tyrosine kinase receptors in the cornea”. Exp. Eye Res. 72 (1): 87—92. DOI:10.1006/exer.2000.0932. PMID 11133186.

Ссылки