CHD7

Хромодомен хеликазы ДНК-связывающего белка 7
PDB 2ckc EBI.png
PDB rendering based on 2ckc.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволCHD7 ; CRG; HH5; IS3; KAL5
Внешние IDOMIM: 608892 MGI2444748 HomoloGene19067 GeneCards: CHD7 Gene
номер EC3.6.4.12
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez55636320790
EnsemblENSG00000171316ENSMUSG00000041235
UniProtQ9P2D1A2AJK6
RefSeq (мРНК)NM_017780NM_001033395
RefSeq (белок)NP_060250NP_001264078
Локус (UCSC)Chr 8:
61.59 – 61.78 Mb
Chr 4:
8.69 – 8.87 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

CHD7 (от англ. Chromodomain-Helicase-DNA-binding protein 7) известный также как АТФ-зависимая хеликаза CHD7 фермент, который у человека кодируется геном CHD7[1][2].

CHD7 является АТФ-зависимым ремодельером хроматина, гомолог белков дрозофилы, относимых к белкам группы Trithorax Kismet[3]. Мутации в CHD7 связаны с синдромом CHARGE[en][4].


Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при исследовании функций CHD7. Условная линия нокаутных мышей под названием Chd7tm2a(EUCOMM)Wtsi[12][13] была создана в рамках международной программы консорциума Нокаутная мышь - проект интенсивного мутагенеза для создания и распространения животных моделей различных заболеваний, с целью заинтересовать учёных[14][15][16].

Сосочек Бергмейстера, гистологический срез.

Мужские и женские особи прошли стандартное фенотипическое обследование, чтобы определить фенотип мутации[10][17]. Было проведено двадцать четыре испытания, проведенные на мутантных мышах и в пяти случаях были замечены значительные нарушения[10]. Гомозиготных мутантов не выявлено в эмбрионах во время беременности, то есть в гомозиготном состоянии мутация оказалась летальной. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных взрослых мышах. Мужские гетерозиготы характеризуются ненормальной высотой таза в модифицированном тесте SHIRPA и имеют высокий сосчек Бергмейстера в обоих глазах. Когда был изучен мозг гетерозиготных животных, обнаружилось отсутствие мозолистого тела[10].

Примечания

  1. Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (February 2000). “Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro”. DNA Res. 7 (1): 65—73. DOI:10.1093/dnares/7.1.65. PMID 10718198.
  2. Entrez Gene: chromodomain helicase DNA binding protein 7.
  3. Bajpai R, Chen DA, Rada-Iglesias A, Zhang J, Xiong Y, Helms J, Chang CP, Zhao Y, Swigut T, Wysocka J (February 2010). “CHD7 cooperates with PBAF to control multipotent neural crest formation”. Nature. 463 (7283): 958—62. DOI:10.1038/nature08733. PMC 2890258. PMID 20130577.
  4. Vissers LE, van Ravenswaaij CM, Admiraal R, Hurst JA, de Vries BB, Janssen IM, van der Vliet WA, Huys EH, de Jong PJ, Hamel BC, Schoenmakers EF, Brunner HG, Veltman JA, van Kessel AG (September 2004). “Mutations in a new member of the chromodomain gene family cause CHARGE syndrome”. Nat. Genet. 36 (9): 955—7. DOI:10.1038/ng1407. PMID 15300250.
  5. Neurological assessment data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  6. Radiography data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  7. Eye morphology data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  8. Salmonella infection data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  9. Citrobacter infection data for Chd7. Wellcome Trust Sanger Institute.
  10. 1 2 3 4 Gerdin AK (2010). “The Sanger Mouse Genetics Programme: High throughput characterisation of knockout mice”. Acta Ophthalmologica. 88: 925—7. DOI:10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x.
  11. Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute.
  12. International Knockout Mouse Consortium.
  13. Mouse Genome Informatics.
  14. Skarnes W. C., Rosen B., West A. P., Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica A. O., Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong P. J., Stewart A. F., Bradley A. A conditional knockout resource for the genome-wide study of mouse gene function. (англ.) // Nature. — 2011. — Vol. 474, no. 7351. — P. 337—342. — DOI:10.1038/nature10163. — PMID 21677750. []
  15. Dolgin E (2011). “Mouse library set to be knockout”. Nature. 474 (7351): 262—3. DOI:10.1038/474262a. PMID 21677718.
  16. Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). “A Mouse for All Reasons”. Cell. 128 (1): 9—13. DOI:10.1016/j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
  17. van der Weyden L, White JK, Adams DJ, Logan DW (2011). “The mouse genetics toolkit: revealing function and mechanism”. Genome Biol. 12 (6): 224. DOI:10.1186/gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.

Литература