CHD4

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4
Protein CHD4 PDB 1mm2.png
PDB представлено на примере 1mm2.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволCHD4 ; CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA
Внешние IDOMIM: 603277 MGI1344380 HomoloGene68175 GeneCards: CHD4 Gene
номер EC3.6.4.12
Профиль экспрессии РНК
PBB GE CHD4 201183 s at tn.png
PBB GE CHD4 201182 s at tn.png
PBB GE CHD4 201184 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez1108107932
EnsemblENSG00000111642ENSMUSG00000063870
UniProtQ14839Q6PDQ2
RefSeq (мРНК)NM_001273NM_145979
RefSeq (белок)NP_001264NP_666091
Локус (UCSC)Chr 12:
6.68 – 6.72 Mb
Chr 6:
125.1 – 125.13 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 — фермент, кодируемый у человека геном CHD4.[1][2][3]

Продукт этого гена относится к семейству геликаз SNF2/RAD54. Оно представляет собой основной компонент нуклеосомного ремоделирования и комплекса деацетилаз и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции. У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка.[3]


Взаимодействия

CHD4, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[4][5][6] гистондезацетилазой 2,[7][8][6] MTA2,[4] SATB1[9] и ATR.[8]

Примечания

  1. Seelig H.P., Moosbrugger I., Ehrfeld H., Fink T., Renz M., Genth E. The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation (англ.) // Arthritis Rheum (англ.) : journal. — 1995. — November (vol. 38, no. 10). — P. 1389—1399. — DOI:10.1002/art.1780381006. — PMID 7575689.
  2. Seelig H.P., Renz M., Targoff I.N., Ge Q., Frank M.B. Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen (англ.) // Arthritis Rheum (англ.) : journal. — 1996. — November (vol. 39, no. 10). — P. 1769—1771. — DOI:10.1002/art.1780391029. — PMID 8843877.
  3. 1 2 Entrez Gene: CHD4 chromodomain helicase DNA binding protein 4.
  4. 1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming. The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — October (vol. 278, no. 43). — P. 42560—42568. — ISSN 0021-9258. — DOI:10.1074/jbc.M302955200. — PMID 12920132.
  5. Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L. Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — UNITED STATES, 1999. — April (vol. 96, no. 9). — P. 4868—4873. — ISSN 0027-8424. — DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. — PMID 10220385.
  6. 1 2 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L. Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex (англ.) // Nature : journal. — ENGLAND, 1998. — October (vol. 395, no. 6705). — P. 917—921. — ISSN 0028-0836. — DOI:10.1038/27699. — PMID 9804427.
  7. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — February (vol. 278, no. 9). — P. 7234—7239. — ISSN 0021-9258. — DOI:10.1074/jbc.M208992200. — PMID 12493763.
  8. 1 2 Schmidt, D R; Schreiber S L. Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4 (англ.) // Biochemistry : journal. — UNITED STATES, 1999. — November (vol. 38, no. 44). — P. 14711—14717. — ISSN 0006-2960. — DOI:10.1021/bi991614n. — PMID 10545197.
  9. Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances (англ.) // Nature : journal. — England, 2002. — October (vol. 419, no. 6907). — P. 641—645. — ISSN 0028-0836. — DOI:10.1038/nature01084. — PMID 12374985.

Литература