CHD4

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4
Protein CHD4 PDB 1mm2.png
PDB представлено на примере 1mm2.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Идентификаторы
СимволCHD4 ; CHD-4; Mi-2b; Mi2-BETA
Внешние IDOMIM: 603277 MGI1344380 HomoloGene68175 GeneCards: CHD4 Gene
номер EC3.6.4.12
Профиль экспрессии РНК
PBB GE CHD4 201183 s at tn.png
PBB GE CHD4 201182 s at tn.png
PBB GE CHD4 201184 s at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez1108107932
EnsemblENSG00000111642ENSMUSG00000063870
UniProtQ14839Q6PDQ2
RefSeq (мРНК)NM_001273NM_145979
RefSeq (белок)NP_001264NP_666091
Локус (UCSC)Chr 12:
6.68 – 6.72 Mb
Chr 6:
125.1 – 125.13 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Геликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 4 — фермент, кодируемый у человека геном CHD4.[1][2][3]

Продукт этого гена относится к семейству геликаз SNF2/RAD54. Оно представляет собой основной компонент нуклеосомного ремоделирования и комплекса деацетилаз и играет важную роль в эпигенетической репрессии транскрипции. У пациентов с дерматомиозитом вырабатываются антитела против этого белка.[3]


Взаимодействия

CHD4, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[4][5][6] гистондезацетилазой 2,[7][8][6] MTA2,[4] SATB1[9] и ATR.[8]

Примечания

  1. Seelig HP, Moosbrugger I, Ehrfeld H, Fink T, Renz M, Genth E (Nov 1995). “The major dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen is a presumed helicase involved in transcriptional activation”. Arthritis Rheum. 38 (10): 1389—99. DOI:10.1002/art.1780381006. PMID 7575689.
  2. Seelig HP, Renz M, Targoff IN, Ge Q, Frank MB (Nov 1996). “Two forms of the major antigenic protein of the dermatomyositis-specific Mi-2 autoantigen”. Arthritis Rheum. 39 (10): 1769—71. DOI:10.1002/art.1780391029. PMID 8843877.
  3. 1 2 Entrez Gene: CHD4 chromodomain helicase DNA binding protein 4.
  4. 1 2 Yao, Ya-Li; Yang Wen-Ming (Oct 2003). “The metastasis-associated proteins 1 and 2 form distinct protein complexes with histone deacetylase activity”. J. Biol. Chem. United States. 278 (43): 42560—8. DOI:10.1074/jbc.M302955200. ISSN 0021-9258. PMID 12920132.
  5. Grozinger, C M; Hassig C A; Schreiber S L (Apr 1999). “Three proteins define a class of human histone deacetylases related to yeast Hda1p”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. UNITED STATES. 96 (9): 4868—73. DOI:10.1073/pnas.96.9.4868. ISSN 0027-8424. PMC 21783. PMID 10220385.
  6. 1 2 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L (Oct 1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. ENGLAND. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. ISSN 0028-0836. PMID 9804427.
  7. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin (Feb 2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. United States. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. ISSN 0021-9258. PMID 12493763.
  8. 1 2 Schmidt, D R; Schreiber S L (Nov 1999). “Molecular association between ATR and two components of the nucleosome remodeling and deacetylating complex, HDAC2 and CHD4”. Biochemistry. UNITED STATES. 38 (44): 14711—7. DOI:10.1021/bi991614n. ISSN 0006-2960. PMID 10545197.
  9. Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi (Oct 2002). “SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances”. Nature. England. 419 (6907): 641—5. DOI:10.1038/nature01084. ISSN 0028-0836. PMID 12374985. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

Литература