CHD3

Хеликазный хромодомен ДНК-связывающего белка 3
Идентификаторы
СимволCHD3 ; Mi-2a; Mi2-ALPHA; ZFH
Внешние IDOMIM: 602120 MGI1344395 HomoloGene62693 GeneCards: CHD3 Gene
номер EC3.6.4.12
Профиль экспрессии РНК
PBB GE CHD3 208807 s at tn.png
PBB GE CHD3 208806 at tn.png
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez1107216848
EnsemblENSG00000170004ENSMUSG00000018474
UniProtQ12873B0QZH7
RefSeq (мРНК)NM_001005271NM_146019
RefSeq (белок)NP_001005271NP_666131
Локус (UCSC)Chr 17:
7.79 – 7.82 Mb
Chr 11:
69.34 – 69.37 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

CHD3 (от англ. Chromodomain-Helicase-DNA-binding protein 3) — фермент, кодируемый у человека геном CHD3.[1][2][3]

Этот ген кодирует члена CHD семейства белков, которые характеризуются наличием хромодоменов (организация модификатора хроматина) и SNF2-связанных хеликазных/АТФазных доменов. Этот белок является одним из компонентов комплекса гистондеацетилаз, называемого Mi-2/NuRD комплексом, который участвует в ремоделировании хроматина при деацетилировании гистонов. Ремоделирование хроматина имеет важное значение для многих процессов, включая транскрипцию. Аутоантитела против этого белка содержатся в подгруппе пациентов с дерматомиозитом. Существуют три альтернативных варианта транскриптов сплайсинга, кодирующих различные изоформы.[3]


Взаимодействия

CHD3, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[4][5] гистондезацетилаза 2[4][6][7] и SERBP1.[8][9]

Примечания

  1. Woodage T, Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P, Collins FS (November 1997). “Characterization of the CHD family of proteins”. Proc Natl Acad Sci USA. 94 (21): 11472—7. DOI:10.1073/pnas.94.21.11472. PMC 23509. PMID 9326634.
  2. Ge Q, Nilasena DS, O'Brien CA, Frank MB, Targoff IN (November 1995). “Molecular analysis of a major antigenic region of the 240-kD protein of Mi-2 autoantigen”. J Clin Invest. 96 (4): 1730—7. DOI:10.1172/JCI118218. PMC 185809. PMID 7560064.
  3. 1 2 Entrez Gene: CHD3 chromodomain helicase DNA binding protein 3.
  4. 1 2 Tong, J K; Hassig C A; Schnitzler G R; Kingston R E; Schreiber S L (October 1998). “Chromatin deacetylation by an ATP-dependent nucleosome remodelling complex”. Nature. ENGLAND. 395 (6705): 917—21. DOI:10.1038/27699. ISSN 0028-0836. PMID 9804427.
  5. Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument-Bromage H; Tempst P; Reinberg D (February 2002). “Role of the Sin3-Histone Deacetylase Complex in Growth Regulation by the Candidate Tumor Suppressor p33ING1”. Mol. Cell. Biol. United States. 22 (3): 835—48. DOI:10.1128/MCB.22.3.835-848.2002. ISSN 0270-7306. PMC 133546. PMID 11784859.
  6. Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin (February 2003). “A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes”. J. Biol. Chem. United States. 278 (9): 7234—9. DOI:10.1074/jbc.M208992200. ISSN 0021-9258. PMID 12493763.
  7. Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Schmiesing John A; Dong Yuanshu; Barak Orr G; Speicher David W; Yokomori Kyoko; Shiekhattar Ramin (August 2002). “A chromatin remodelling complex that loads cohesin onto human chromosomes”. Nature. England. 418 (6901): 994—8. DOI:10.1038/nature01024. ISSN 0028-0836. PMID 12198550.
  8. Lemos, Taíla A; Passos Dario O; Nery Flávia C; Kobarg Jörg (January 2003). “Characterization of a new family of proteins that interact with the C-terminal region of the chromatin-remodeling factor CHD-3”. FEBS Lett. Netherlands. 533 (1—3): 14—20. DOI:10.1016/S0014-5793(02)03737-7. ISSN 0014-5793. PMID 12505151.
  9. Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H, Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Goedde Astrid, Toksöz Engin, Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E (September 2005). “A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome”. Cell. United States. 122 (6): 957—68. DOI:10.1016/j.cell.2005.08.029. ISSN 0092-8674. PMID 16169070. Используется устаревший параметр |coauthors= (справка)

Литература